目前，企业要申报高新技术企业有两种方式，一种是企业自己申报，另外一种是委托代理机构申报高新技术企业。下面小编就给大家分析分析这两种申报方式的利弊吧。
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企业自己申报的好处：
1、省钱。可以减少委托代理机构的费用。
企业自己申报的弊端：
1、对申报条件和程序不熟悉。申报高新技术企业需要满足八大条件，并且是缺一不可的，才能有资格进入申报的下一个步骤。虽然在“高新技术企业认定管理办法”和“高新技术企业管理指引”中有说明，但是官方文件晦涩难懂。因此，企业对申报过程和项目申报书不熟悉，没有思路与整体规划。
2、对政策的解读不够深入。高企认定的条件中企业要拥有自己的知识产权，允许企业可以通过购买专利获得。然而企业可能所购专利与企业核心业务产品无法建立联系，财务报表上也无法体现出来，表面上是符合了政策的条件，但是在专家评审时不会通过。
3、耗费大量精力和人力。申报材料由企业自行撰写，涉及的内容非常多。企业还需要自行递交材料、备案、办理流程。大部分企业都没有专门的部门去负责高新技术企业认定，导致申报的准备过程中可能耗费大量的精力和人力，也不一定能取得理想的效率和效果。
4、成功率低。对于材料的质量要求逐年提高，辛苦完成的材料因各种问题被地方科技局打回票的也时有发生，有的问题有可能是不可逆的，从而企业错失了一年的申报时机，也浪费审计费和知识产权费用。
找代理机构的好处：
1、前期精准评估。代理机构在签约前会上门评估，综合考量企业各方面条件，以确保了高新技术企业认定的通过率。并且了解高新技术企业申报每一个阶段的关键成功要素，可以为申请人提供合理且专业的建议。
2、思路清晰，有整体规划。代理机构常年从事项目申报，对于高新技术企业申报条件、材料要求以及整套材料的编制、申报流程都非常清楚，需要准备的书件和资料等，代理机构都会帮助事先审查和补正，申报成功的可能性会更高。
3、省时、省力、省心。和代理机构签订协议后，从查询、填报直到公告、注册、领证等都是代理公司的事情了。并且在知识产权和审计这块，全部承包给代理机构了，一站式服务，省时、省力、省心。可以把节约下来的时间和精力，做开展企业另外的业务。
4、熟悉流程。正规的代理机构常年从事项目申报，经常与相关部门有良好的工作沟通，知道什么问题找什么部门，这也能够为高企申报工作提供较大的便利和帮助。
5、后续工作有保障。如果是代理公司负责代理申报，申请成功之后，每年还需要填报各种各样的系统数据和表格，每三年还要参与重新认定。
如果通过专业的机构申报成功后，一般情况下，代理机构每年还会愿意提供专业的问题咨询服务，同时每年还会提供专业的知识产权维护服务，这样才能避免很多企业自己不容易注意的问题。
找代理机构的弊端：
1、需要支出委托代理机构的费用。
不管如何，还是要看企业自身情况，如果是条件符合高新技术企业认定要求，也很有申报项目经验的，当然是企业资金申报好。但如果是企业自身很少申报政府的科技项目，对材料组织编写缺乏经验，某些条件不是很符合，又非常想要申请到这个证书，在这种情况下，聘请专业有经验的代理机构，是Z合适的选择。